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學(xué)術(shù)交流
【學(xué)術(shù)報(bào)告】研究生靈犀學(xué)術(shù)殿堂第460期之胡繼繁教授報(bào)告會(huì)通知
全校師生:
我校定于2019年5月11日舉辦研究生靈犀學(xué)術(shù)殿堂——胡繼繁教授報(bào)告會(huì),現(xiàn)將有關(guān)事項(xiàng)通知如下:
1.報(bào)告會(huì)簡(jiǎn)介
報(bào)告人:胡繼繁教授
時(shí)間:2019年5月11日(星期六)上午11:30
地點(diǎn):西北工業(yè)大學(xué)國(guó)際會(huì)議中心第五會(huì)議室
報(bào)告題目:Functional characterization of lncRNAs as epigenetic messengers in cancers by combining RAT-seq and CRIST-seq assays
內(nèi)容簡(jiǎn)介:人類(lèi)基因組的很大一部分編碼非蛋白編碼基因,這些基因被廣泛地轉(zhuǎn)錄為長(zhǎng)非編碼RNA (lncRNA)。現(xiàn)在很清楚的是,這些lncNRAs作為調(diào)控復(fù)合物的關(guān)鍵表觀遺傳學(xué)參與者,對(duì)癌癥的發(fā)展和進(jìn)展至關(guān)重要。目前,大多數(shù)研究都集中在它們?cè)诩?xì)胞溶膠中隔離功能miRNA的“海綿”作用上。然而,我們對(duì)大量核lncRNA的作用知之甚少,它們要么富含染色質(zhì)復(fù)合物,要么定位于特定的亞核區(qū)。我們建議使用RAT-seq和CRIST-seq結(jié)合來(lái)描述核lncRNA作為癌癥中的表觀遺傳信息載體。
Friend leukemia virus integration 1 (FLI1)是ETS轉(zhuǎn)錄因子家族成員之一,在血液病惡性腫瘤和實(shí)體腫瘤中均作為致癌驅(qū)動(dòng)因子。然而,在腫瘤中激活這種原癌基因的調(diào)控因素仍不清楚。利用CRIST-Seq,我們繪制了FLI1啟動(dòng)子染色質(zhì)復(fù)合物中的RNA組分,并鑒定了兩個(gè)環(huán)狀RNA,分別由FLI1外顯子4-2-3和外顯子5-2-3-4組成,稱(chēng)為FECRs (FLI1外顯子環(huán)狀RNA)。FECR1增強(qiáng)了MDA-MB231乳腺癌細(xì)胞的侵襲性。機(jī)制上,我們發(fā)現(xiàn)FECR1利用正反饋機(jī)制通過(guò)誘導(dǎo)啟動(dòng)子CpG島的DNA低甲基化來(lái)激活致癌的FLI1。FECR1與順式FLI1啟動(dòng)子結(jié)合并募集TET1,這是一種積極參與DNA去甲基化的脫甲基酶。利用RAT-seq,我們發(fā)現(xiàn)FECR1與反式DNMT1結(jié)合并下調(diào)。反式甲基轉(zhuǎn)移酶對(duì)維持DNA甲基化至關(guān)重要。這些數(shù)據(jù)表明,致癌的FLI1不僅通過(guò)典型的癌蛋白通路,而且通過(guò)其外顯子環(huán)狀RNA介導(dǎo)的表觀遺傳機(jī)制驅(qū)動(dòng)腫瘤轉(zhuǎn)移。FECR1環(huán)狀RNA是一種上游表觀遺傳調(diào)節(jié)劑,通過(guò)在順式和反式中協(xié)調(diào)DNA甲基化和去甲基化酶來(lái)控制乳腺腫瘤的生長(zhǎng)。LncND5是線粒體基因組編碼的lncRNA,其以反義ND5基因轉(zhuǎn)錄。 在肺腺癌細(xì)胞中,我們驚奇地發(fā)現(xiàn)這種線粒體lncRNA異常轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核。 使用RAT-seq,我們分析了其全基因組目標(biāo)相互作用組,并鑒定了腫瘤抑制因子BACH2的內(nèi)含子3增強(qiáng)子作為lncND5的關(guān)鍵核靶點(diǎn)。敲除LncND5增加BACH2表達(dá),并抑制細(xì)胞增殖、侵襲和粘附。 BACH2啟動(dòng)子中的六個(gè)CpG島由肺腺癌細(xì)胞中的lncND5進(jìn)行表觀遺傳學(xué)調(diào)節(jié)。 這些數(shù)據(jù)表明線粒體編碼的lncND5異常轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核,在細(xì)胞核中與腫瘤抑制基因BACH2基因的增強(qiáng)子結(jié)合,并在表觀遺傳學(xué)上調(diào)控BACH2表達(dá)。
總的來(lái)說(shuō), RAT-seq和CRIST-seq的結(jié)合可以用作在癌癥發(fā)展和進(jìn)展中繪制功能性lncRNA的一種有用方法。
2.歡迎各學(xué)院師生前來(lái)聽(tīng)報(bào)告。報(bào)告會(huì)期間請(qǐng)關(guān)閉手機(jī)或?qū)⑹謾C(jī)調(diào)至靜音模式。
黨委學(xué)生工作部
生命學(xué)院
2019年5月5日
報(bào)告人簡(jiǎn)介
胡繼繁,教授,博士生導(dǎo)師,吉林大學(xué)“唐敖慶學(xué)者”,吉林省優(yōu)秀歸國(guó)人才。主要研究方向?yàn)槟[瘤干細(xì)胞、表觀遺傳學(xué)和長(zhǎng)鏈非編碼RNA相關(guān)基礎(chǔ)研究。在美國(guó)斯坦福大學(xué)腫瘤和干細(xì)胞表觀遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)室任職期間,先后以P.I.和Co-P.I.的身份完成美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究所/美國(guó)國(guó)立癌癥研究所(NIH/NCI)和美國(guó)國(guó)防部(US Department of Defense, DoD)的科研課題三項(xiàng),2012年成功獲得關(guān)于長(zhǎng)鏈非編碼RNA的國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目一項(xiàng),2014年成功獲得關(guān)于長(zhǎng)鏈非編碼RNA的國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目一項(xiàng)。以第一作者和通訊作者在包括Science、cell stem cell、Nat Communication、Nucleic Acids Research等國(guó)際頂尖雜志上發(fā)表SCI論文80余篇,被引次數(shù)超過(guò)5000次。